Свято-Николаевский кафедральный собор в Купянске был построен в 1848-1852 по проекту Федора Данилова.
Первый деревянный храм в честь св. Николая в Купянске существовал с 1705 по 1824 гг.
Новый храм был построен на средства помещика Ананьина и прихожан, с участием предводителя дворянин Клепацкого. Его стиль – эклектичный, с элементами классицизма и русско-византийской архитектуры, официально доминировавшей в первой половине XIX в. Свято-Николаевский храм является памятником архіитектуры.
Одновременно с храмом слева и справа от входа были построены служебные флигели в том же стиле. В 1860-х на участке церкви высадили сад, ставший сквером.
В 1870-х гг. к храму были пристроены два нефа.
В 1932 г. купол и колокольня были снесены, в алтарной части храма торговали мясом.
С 1940-х гг. в Свято-Николаевском храме снова начали проводить службы. Постепенно, с конца 1980-х, его начали восстанавливать, но полноценно восстановлен в оригинальном виде он был позже – в 2000-х гг. по проекту архитектора Владимира Новгородова и Юрия Лиханского.
Следует отметить, что позолоту из нитрида титана купол и завершение колокольни получили только в 2015 г., до этого они были покрыты более аутентичными черными медными листами (форма бани была в процессе замены кровли несколько изменена). Храм украшали более 10 икон XIX века, выполненных слобожанскими мастерами из сл. Борисовка.
Территория храма пострадала в результате обстрела российских войск 26 сентября 2022 г.
В результате обстрела сгорела воскресная школа и церковный магазин.
Но сам храм и его интерьеры на фотографиях августа 2025 года еще были в хорошем состоянии.
2026 год церковь не пережила. В результате обстрелов российских войск была разрушена колокольня, была повреждена крыша и служебные здания храмового комплекса.
